Netbooky sa líšia od počítačov a notebookov veľkosťou a výkonom hardvéru. Spravidla majú slabšiu náplň ako ich staršie náprotivky. To znamená, že operačný systém (OS) nainštalovaný na zariadení sa musí zhodovať s hardvérom netbooku, aby bola práca na notebooku čo najkomfortnejšia.
Windows
Najlepšou voľbou pre prácu s netbookom je Windows 7. Tento operačný systém je zvyčajne dodávaný predinštalovaný a nekladie zvýšené nároky na hardvér, vhodný pre netbook, ktorý má 1 GB RAM a rozlíšenie obrazovky 1024x768. Vaše prenosné zariadenie môže byť jednojadrové s procesorom 1,2 GHz, ale lepší výkon systému môžete dosiahnuť, ak použijete netbook s 2 alebo viacerými procesorovými jadrami.
Ak váš počítač nespĺňa požiadavky Windows 7, môžete si doň nainštalovať Windows XP, ktorý bude stačiť na spustenie na netbooku s 256 MB RAM a taktom procesora 1,2 GHz alebo menej.
Tento operačný systém úspešne zvládne všetky úlohy, ktoré chcete na zariadení vykonať - môžete spustiť akékoľvek kancelárske aplikácie a programy pre prácu na internete.
Porovnateľne novšie dvojjadrové netbooky s viac ako 1 GB RAM môžu pracovať so systémom Windows 8. Líši sa od Windows 7 vylepšeným výkonom a aktualizovaným rozhraním. Váš netbook musí mať displej schopný zobrazovať prvky obrazovky v rozlíšení 1 024 x 768. Je však vhodné, aby obrazovka vášho netbooku podporovala vyššie rozlíšenie, aby ste sa mohli pohodlne pohybovať v ponukách systému Metro.
Linux
Operačné systémy rodiny Linux sú alternatívou k Windows. Vyznačujú sa nízkymi systémovými požiadavkami a možno ich použiť na vykonávanie akýchkoľvek úloh týkajúcich sa práce s počítačom.
Medzi užívateľsky prívetivejšie distribúcie Linuxu sa dobre hodí Ubuntu. Tento systém sa vyznačuje schopnosťou inštalovať pracovnú plochu Unity, ktorá je práve prispôsobená pre notebooky a netbooky. Pomocou tohto rozhrania môžete rýchlo vyvolať potrebné funkcie systému a pracovať s programami.
Na inštaláciu najnovšieho Ubuntu (13.10) nepotrebujete viac ako 512 MB RAM a jednojadrový procesor s frekvenciou 1,4 GHz.
Alternatívne distribúcie pre používateľov systému Linux zahŕňajú Suse, Mint (založené na Ubuntu) a Mandriva. Pre pokročilejších používateľov sú systémy ako Slackware a Debian v poriadku. Charakteristickou vlastnosťou systému Linux je schopnosť doladiť, jeho otvorenosť, a teda schopnosť čo najviac optimalizovať váš operačný systém pre prácu s netbookom.