Total Commander je populárny program, ktorý si získal slávu vďaka ľahkému použitiu, veľkému počtu doplnkov a prítomnosti jedinečných nastavení, ktoré vo väčšine ostatných správcov súborov nie sú k dispozícii. Total Commander má napriek tomu množstvo alternatívnych programov, ktoré nemajú o nič menšiu funkčnosť a môžu byť dobrou náhradou.
FAR manažér
Jednou z najpopulárnejších alternatív k Total Commander je FAR Manager. Tento program má podobnú sadu funkcií, ale líši sa rozhraním a niektorými funkciami. Rovnako ako Total Commander, aj táto aplikácia má veľké množstvo dostupných doplnkov, ktoré pomôžu vylepšiť funkčnosť aj toho najnáročnejšieho používateľa. Pokiaľ ide o súbor možností, FAR nezaostáva za svojim náprotivkom, je úplne zadarmo a je aktívne vyvíjaný komunitou programátorov. FAR má podobné dvojpanelové rozhranie implementované v textovom formáte, vďaka čomu je správca súborov ľahko použiteľný a rýchlo sa ovláda aj na slabých počítačoch.
FAR má tiež témy a funkcie programu je možné plne ovládať pomocou klávesnice.
FreeCommander
FreeCommander je bezplatná alternatíva k Total Commander. Rovnako ako jeho predchodca, aj FreeCommander má viacjazyčné prispôsobiteľné rozhranie a širokú škálu nastavení. Funkciou programu je jeho schopnosť spustiť z flash disku ako prenosnú verziu v ľubovoľnom systéme Windows. Aplikácia je rýchla, má schopnosť prezerať archívy v obyčajnom texte aj v hexadecimálnom a binárnom formáte. Na rozdiel od FAR, obslužný program podporuje funkciu Drag & Drop a dokáže sa pripojiť k vzdialeným serverom FTP. FreeCommander sa môže stať úplnou alternatívou k Total Commander.
Nevýhodou FreeCommanderu je chýbajúci systém modulov a schopnosť integrovať svoje vlastné rozšírenia.
Directory Opus
Directory Opus je platený správca súborov s multifunkčným rozhraním, ktorý bude dobrým pomocníkom pri práci s rôznymi súbormi. Rovnako ako Total Commander, aj aplikácia disponuje viacjazyčným rozhraním, možnosťou meniť dizajn pomocou niekoľkých tlačidiel. Program má pokročilejšiu funkciu filtrovania a vyhľadávania súborov, je schopný synchronizovať údaje, vyhľadávať duplikáty v systéme. Directory Opus má veľké množstvo pluginov, ktorých však nie je až tak veľa v porovnaní s FAR alebo Total Commander. Program je schopný automatických aktualizácií a je k dispozícii pre 32 a 64-bitové architektúry Windows. Aplikáciu je možné spustiť aj z USB flash disku.
Medzi ďalšie alternatívy patrí aplikácia Double Commander s podporou doplnkov od celkového veliteľa. Existujú aj Unreal Commander a Speed Commander, ktoré prakticky opakujú funkčnosť Total Commander, ale majú trochu odlišný dizajn a strom nastavení.