Veľkou nevýhodou mnohých mobilných počítačov je nekvalitný chladiaci systém. Zlý výkon ventilátora môže byť spôsobený množstvom nezávislých faktorov.
Hlavným dôvodom prehriatia mobilného počítača je zlá kvalita integrovaného chladiaceho systému zariadenia. Ventilátory vo vnútri puzdra mobilného počítača sami nechladia vzduch. Poskytujú iba príliv chladného vzduchu zvonka, čím znižujú teplotu určitých zariadení. Operačné systémy používané v mobilných počítačoch majú špeciálne funkcie, ktoré riadia parametre činnosti určitých zariadení. To je nevyhnutné na zabezpečenie dlhej životnosti batérie notebooku. Bohužiaľ, energia sa často šetrí znížením výkonu chladičov. To môže viesť k prehriatiu niektorých zariadení. Ak sa vo vnútri prenosného počítača a na lopatkách ventilátora nahromadí veľké množstvo prachu, výrazne to zníži úroveň prúdenia vzduchu vo vnútri počítača. Toto je veľmi častá príčina prehriatia v takomto zariadení. Nesprávne použitie počítača môže navyše spôsobiť zvýšenie teploty vo vnútri mobilného počítača. V spodnej a bočnej rovine skrinky sú zvyčajne ventilačné otvory. Niektoré sú navrhnuté tak, aby umožňovali prenikanie vzduchu do vnútra puzdra, zatiaľ čo iné sú určené na jeho extrakciu. Ak si laptop položíte napríklad na brucho, môžete zablokovať dôležité ventilačné otvory. Starý tepelný tuk na procesore a grafickej karte môže spôsobiť prehriatie vášho notebooku. Zvyčajne v takýchto prípadoch dochádza k miestnemu zvýšeniu teploty jednotlivých zariadení. Aby sa zabránilo prehriatiu mobilného počítača, je potrebné správne nakonfigurovať plán napájania, včasne vyčistiť ventilátory a vnútro počítača. Ak tieto prostriedky nepomáhajú, použite chladiacu podložku so zabudovanými chladičmi.
